António Afonso de Deus é licenciado em arquitetura (1994) pela Universidade Lusíada de Lisboa, mestre em Patologia e Restauro Arquitetónico (1998) pela Universidade da Corunha e em Arquitetura (2011) pela Universidade Lusófona do Porto.
Teve experiências profissionais nas Câmaras Municipais do Porto (1998-1999) e de Oliveira de Azeméis (2000-2006) e é professor no ensino superior desde 1999: na Universidade Moderna do Porto (1999-2006) e na Universidade Lusófona do Porto, no curso de Mestrado Integrado em Arquitetura (desde 2005).
Ingressou na segunda edição do programa de doutoramento Patrimónios de Influência Portuguesa (PIP) do Instituto de Investigação Interdisciplinar (III) e do Centro de Estudos Sociais da Universidade de Coimbra (CES) (2012), onde se encontra a desenvolver a dissertação intitulada A Cidade nos limites do império. Missões e caminhos de ferro na construção da cidade nos planaltos de Angola (1870-1930), em relação à qual recebeu financiamento do PIP para deslocação no território de estudo.
Entre os seus interesses como investigador e na interação com a sua atividade profissional (arquitetura e docência), privilegia um conhecimento onde os estudos sobre a arquitetura se relacionam com o urbanismo, na formação dos aglomerados urbanos, de uma cultura sobre a “periferia”, do rural para o urbano.